تنبؤ بالبنية البروتينية
التنبؤ بالبنية البروتينية إحدى الطرق المعلوماتية الحيوية والكيمياء النظرية لاستخراج نموذج لشكل البنية البروتينية في شكلها الثلاثي الأبعاد للبروتينات انطلاقا من المعلومات عن تسلسل الحموض الأمينية ضمن البروتين. بشكل آخر، يمكن أن نقول أنه التنبؤ بالبنية الثالثية اعتبارا من البنية الأولية. مثل هذا الموضوع وتشكيل نماذج للبنية الثالثية للبروتين له تطبيقات عملية كثيرة مثل تصميم الدواء المنطقي rational drug design الذي يعد أحد أكثر الحقول نشاطا بحثيا في الوقت لاراهن كل عامين يتم تقييم فعالية الطرق الحالية من خلال تجربة كاسب CASP.
انظر أيضا
مراجع
Bonneau R, Baliga NS, Deutsch EW, Shannon P, Hood L. (2004) Comprehensive de novo structure prediction in a systems-biology context for the archaea Halobacterium sp. NRC-1.Genome Biology. 5(8):R52-68
| طرق تحديد البنية البروتينية | ||
|---|---|---|
| دقة عالية: | دراسة البلورات بالأشعة السينية | NMR | Electron crystallography | |
| دقة متوسطة: | Cryo-electron microscopy | Fiber diffraction | Mass spectrometry | |
| مطيافية: | NMR | Circular dichroism | Absorbance | Fluorescence | Fluorescence anisotropy | |
| انتشار انتقالي: | Analytical ultracentrifugation | Size exclusion chromatography | Light scattering | NMR | |
| انتشار دوراني: | لاتماثل المناحي التألقي Fluorescence anisotropy | انكسار التدفق الثنائي Flow birefringence | إرخاء ثنائي الكهربية | NMR | |
| طرق كيميائية: | مبادلة هيدروجين-دوتيريوم | استطفار موجه-الموقع | تعديل كيميائي | |
| طرق ترموديناميكية: | فك تطوي توازني Equilibrium unfolding | |
| طرق حاسوبية: | التنبؤ بالينية البروتينية | إقحام جزيئي Molecular docking | |
| →بنية ثالثية | البنية الرابعية← | |
Protein structure prediction]] es:Predicción de la estructura de las proteínas it:Predizione di struttura proteica ja:タンパク質構造予測 no:Proteinstrukturprediksjon ru:Предсказание структуры белка sr:Предвиђање структуре протеина
